Работа выполнена без спонсорской поддержки.
Калинникова Т.Б. Почвенная нематода Caenorhabditis elegans как модель для изучения паразитических нематод. Лабораторные животные для научных исследований. 2024; 1. https://doi.org/10.57034/2618723X-2024-01-07
Свободноживущая почвенная нематода Caenorhabditis elegans (C. elegans) используется в качестве модельного организма в биологических исследованиях с середины 1960-х годов. Преимуществами C. elegans как экспериментальной модели для изучения биологии Metazoa являются короткий жизненный цикл, маленькие размеры тела, высокая плодовитость, простота и дешевизна выращивания в лаборатории и безопасность для исследователей. Дискуссия о возможности использования C. elegans как модели паразитических нематод ведется с первых упоминаний этой нематоды в научной литературе. В этой статье приведен обзор экспериментальных исследований, показывающих, что во многих случаях вещества, токсичные для C. elegans, токсичны для паразитических нематод, и наоборот. Это позволяет сделать вывод о перспективности использования C. elegans для первичного скрининга веществ с нематоцидной активностью с последующим их тестированием на паразитических нематодах. Не вызывает сомнения и возможность использования C. elegans для понимания механизмов действия нематоцидов. В целом, можно сделать вывод, что C. elegans является полезной моделью как для поиска новых веществ с антигельминтной активностью, так и для решения проблемы преодоления лекарственной устойчивости гельминтов.
Свободноживущая почвенная нематода Caenorhabditis elegans (C. elegans) была предложена в качестве модельного организма Сиднеем Бреннером в середине 1960-х годов [1]. Преимуществами C. elegans как экспериментальной модели для изучения биологии Metazoa являются короткий жизненный цикл, маленькие размеры тела, высокая плодовитость (около 300 потомков у одной особи), простота и дешевизна выращивания в лаборатории и безопасность для исследователей (в отличие от паразитических нематод C. elegans не может размножаться и развиваться при температуре тела человека) [1–3].
Возможность культивирования C. elegans в лаборатории в стандартных условиях на искусственной среде сделала эту нематоду удобным объектом для изучения антигельминтной активности химических соединений. Сторонники таких исследований опираются на сходство общего плана строения тела и физиологии C. elegans и паразитических нематод, а также на особенности строения и функций нервной системы, характерные для всех нематод. Между тем вопрос о корректности экстраполяции данных, полученных в экспериментах с C. elegans, на всех представителей типа Nematoda остается открытым.
Цель настоящей работы — проведение анализа научной литературы, подтверждающей возможность использования C. elegans для оценки эффективности антигельминтных препаратов.
Представленный обзор обобщает научные публикации об использовании C. elegans в качестве модели для изучения паразитических Nematoda. Поиск публикаций проводили в базах данных PubMed и Google Scholar. В обзор включали публикации, доступные для поиска на 28.11.23. Поиск информации осуществляли на основе ключевых слов. Ключевые слова были определены на русском и английском языках: «Caenorhabditis elegans + parasitic nematodes + anthelmintic researches + nematicides + anthelmintic drugs» и «Caenorhabditis elegans + паразитические нематоды + антигельминтные препараты + нематоциды».
Поиск новых веществ для борьбы с паразитическими нематодами осложняется многими факторами, к которым относятся особенности жизненного цикла, невозможность культивирования многих паразитических нематод вне организма хозяина, трудности получения в лаборатории удобных для исследования in vitro стадий развития нематод, недостаток знаний о генетике, нейрохимии и молекулярной биологии паразитических нематод, высокая стоимость экспериментов. Обойти большинство этих ограничений позволяет использование в качестве модельного организма свободноживущей почвенной нематоды C. elegans. При этом открытым остается вопрос о возможности экстраполяции данных, полученных при исследовании C. elegans, на всех представителей типа Nematoda как свободноживущих, так и паразитических. Обсуждению этого вопроса посвящено несколько обзоров [2, 4–8]. Несмотря на большие различия жизненного цикла и среды обитания свободноживущих и паразитических нематод, сходство общего плана строения тела и физиологии делает C. elegans удобной моделью для изучения антигельминтных препаратов. Строение и функции нервно-мышечной системы нематод высококонсервативны в эволюции. Одной из особенностей строения нервной системы многих нематод является ее простота. Например, нервная система C. elegans состоит всего из 302 нейронов, родословная, расположение, морфология и функции каждого строго фиксированы. То же самое можно сказать и про нервную систему Ascaris suum (A. suum), состоящую из 298 нейронов. Брюшная нервная цепочка C. elegans и A. suum состоит соответственно из 57 и 55 моторных нейронов, относящихся к семи подтипам, и каждому нейрону C. elegans соответствует гомологичный нейрон A. suum [9]. Все нематоды используют ацетилхолин, γ-аминомасляную кислоту (ГАМК) и глутамат в качестве нейротрансмиттеров. Особенностью фармакологии нервной системы всех нематод, включая C. elegans, является использование большого количества нейропептидов наряду с классическими нейротрансмиттерами [6, 8, 10]. В целом, можно говорить, что C. elegans отличается от других видов нематод не более чем разные виды нематод разнятся между собой [6].
Несмотря на явные преимущества C. elegans в качестве модельного организма, эта модель, как и многие другие, имеет определенные ограничения. Известно большое количество видоспецифических генов паразитических нематод, не имеющих гомологов в геноме C. elegans, и наоборот. Примерно 25% генов уникальны для каждого из видов Nematoda. Все это определяет необходимость проведения параллельных исследований C. elegans и паразитических нематод [2, 11]. Наличие у C. elegans кутикулы, защищающей ее от внешних воздействий как физических, так и химических, предъявляет особые требования к дизайну экспериментов. Сюда относятся повышение концентрации исследуемых веществ, использование добавок, облегчающих проникновение веществ через кутикулу, и применение мутантных линий с повышенной проницаемостью кутикулы.
Результаты исследований, в которых изучается действие токсикантов одновременно на C. elegans и паразитических нематод, позволяют использовать C. elegans в качестве первичного фильтра при скрининге для выявления потенциальных нематоцидов с последующим их изучением на паразитических нематодах [4, 6–7, 12–15]. Помимо поиска эффективных антигельминтных средств, исследования C. elegans благодаря наличию большого количества мутантных линий позволяют идентифицировать молекулярные мишени и механизмы действия нематоцидов [6, 7]. Это в свою очередь имеет большое значение для решения проблемы лекарственной устойчивости гельминтов.
C. elegans является удобной моделью для изучения биохимических процессов в организмах нематод на всех уровнях организации (клетки, ткани, органы, целый организм). У нематод имеется несколько особенностей метаболизма, отличающих их от других животных. Особенностью всех нематод является использование альтернативной электрон-транспортной цепи, в которой конечным акцептором электронов является не кислород, а фумарат; в качестве переносчика электронов вместо убихинона используется родохинон [2, 16]. Еще одной особенностью метаболизма C. elegans и других нематод, отличающей их от млекопитающих, является глиоксилатный цикл, представляющий собой видоизмененный цикл трикарбоновых кислот. Глиоксилатный цикл характерен для всех нематод на стадии эмбриогенеза и покоящихся форм [17]. Другой особенностью, характерной для нематод, является трегалозный цикл, в результате которого синтезируется трегалоза — дисахарид, необходимый для защиты организма от неблагоприятных воздействий окружающей среды, таких как высыхание, осмотический стресс, аноксия, замораживание, высокая и низкая температура среды [17]. Помимо этого, трегалозный цикл является ключевым метаболическим путем глюконеогенеза у нематод [18, 19].
Необходимо упомянуть и отсутствие у нематод, включая C. elegans, ферментов, необходимых для синтеза гема; нематоды получают гем из экзогенных ресурсов [20]. Гены переносчиков гема были выявлены не только у C. elegans, но и у паразитической нематоды Brugia malayi [21]. В отличие от позвоночных животных нематоды не способны синтезировать de novo стеролы, в частности, холестерин [22]. В качестве сигнальных молекул нематоды используют такие вещества, как аскарозиды, немамиды, дафахроновая кислота и др. [23, 24].
Бензимидазолы (альбендазол, мебендазол, беномил и др.) используют с 1960-х годов для лечения животных и человека при гельминтозах [6–7, 25]. Антигельминтное действие бензимидазолов основано на их взаимодействии с β-тубулином. Устойчивость C. elegans к бензимидазолам определяется мутацией гена ben-1, кодирующего β-тубулин. Устойчивость Haemonchus contortus к бензимидазолам также связана с наличием специфических аллелей гена β-тубулина [6, 7].
Мишенью действия многих пестицидов и лекарственных препаратов является холинергическая синаптическая трансмиссия. Одним из первых инсектицидов был никотин, агонист никотиновых рецепторов ацетилхолина (н-холинорецепторов). Многие препараты, которые применяют для лечения гельминтозов у человека и животных, являются агонистами (левамизол, пирантел, оксантел, монепантел и др.) либо антагонистами (спироиндолы) н-холинорецепторов [6, 7, 26–34].
Первые мутантные линии C. elegans были описаны в работе S. Brenner [1]. Среди этих мутантов были нематоды, способные передвигаться по агару, содержащему 10–4 М левамизола, быстрее, чем нематоды линии дикого типа. У устойчивых к левамизолу мутантов наблюдались изменения поведения, сходные с теми, которые вызывал ингибитор ацетилхолинэстеразы ланнат, и это позволило S. Brenner [1] сделать вывод, что левамизол является агонистом ацетилхолина. Позднее были описаны гены всех пяти белковых субъединиц рецептора левамизола [35–37]. Электрофизиологические исследования паразитической нематоды Oesophagostomum dentatum показали, что изменения свойств н-холинорецепторов определяют устойчивость не только к левамизолу, но и к другому агонисту ацетилхолина пирантелу [35].
Как у позвоночных, так и у беспозвоночных животных н-холинорецепторы являются лигандзависимыми ионными каналами, состоящими из пяти белковых субъединиц. Идентифицированные рецепторы ацетилхолина различаются между собой как по селективности формируемых ими ионных каналов, так и по чувствительности к агонистам и антагонистам [26, 38, 39]. Семейство генов н-холинорецепторов у C. elegans состоит из 29 генов, которые объединяют в 5 групп. Наибольший интерес для исследователей представляет группа ACR-16, состоящая из 11 субъединиц, соответствующих α7-субъединицам н-холинорецепторов человека. У C. elegans ACR-16 формирует гомомерный н-холинорецептор N-субтипа, чувствительный к никотину. Для формирования рецептора, чувствительного к левамизолу (рецептор L-субтипа), необходима коэкспрессия пяти различных субъединиц н-холинорецепторов: двух α-субъединиц (UNC-38 и UNC-63) и трех не-α-субъединиц (UNC-29, LEV-1 и LEV-8).
Изученные к настоящему времени семейства генов н-холинорецепторов у других беспозвоночных существенно меньше, чем у C. elegans. У нематоды Brugia malayi (B. malayi), поражающей лимфатическую систему человека, и у Trichinella spiralis (T. spiralis) — паразита плотоядных млекопитающих, включая человека, выявлено по 8 субъединиц н-холинорецепторов. Как и у C. elegans, эти субъединицы объединяются в 5 групп. Отсутствие у B. malayi и T. spiralis ортологов LEV-1 и LEV-8 может свидетельствовать о более простой структуре н-холинорецептора L-субтипа у паразитических нематод. Этот вывод подтверждается исследованием паразитической нематоды Ascaris suum (A. suum), у которой для формирования н-холинорецепторов достаточно двух субъединиц: UNC-38 и UNC-29. Формирование рецептора L- или N-субтипа зависит от соотношения UNC-38:UNC-29 соответственно 1:5 или 5:1. Преобладание UNC-29 приводит к формированию рецептора L-субтипа, а UNC-38 формирует рецептор N-субтипа [40]. В отличие от C. elegans рецептор левамизола у A. suum может активироваться высокими концентрациями никотина [41,42]. Помимо рецепторов L- и N-субтипа, у A. suum выявлен чувствительный к бефениуму н-холинорецептор B-субтипа [6, 28, 43].
В работе R. Kaminsky и соавт. [15] описана устойчивость C. elegans и паразитических нематод (Haemonchus contortus, Trichostrongylus colubriformis, Cooperia oncophora, Ostertagia ostertagi, Nematodirus spathiger, Teladorsagia circumcincta и Chabertia ovina) к производным аминоацетонитрила (AADs). В экспериментах с C. elegans показано, что мишенью действия этих соединений является н-холинорецептор, отличный от рецепторов L- и N-субтипа. Устойчивость C. elegans к AADs определяется мутациями в генах acr-17 и acr-23, относящихся к семейству DEG-3 н-холинорецепторов. У C. elegans и Haemonchus contortus (H. contortus) были идентифицированы гены des-2, также относящиеся к семейству DEG-3. У H. contortus, устойчивых к AADs, функции гена des-2 были нарушены частично или полностью, в то время как у C. elegans мутации этого гена не вызывали устойчивости к AADs. Устойчивость к AADs была выявлена и у H. contortus с мутациями в гене, гомологичном гену acr-23 C. elegans [6, 15].
Макроциклические лактоны в качестве антигельминтных препаратов используются с 1980-х годов. Первыми препаратами этой группы были авермектин, выделенный из Streptomyces avermitilis, и его полусинтетический аналог ивермектин [6, 7, 44, 45]. Показано, что ивермектин взаимодействует со многими лигандзависимыми ионными каналами с наибольшим сродством к глутаматзависимым Cl–-каналам (GluCls), что и определяет его высокую антигельминтную активность. У C. elegans устойчивость к ивермектину определяется тремя генами (avr-15, avr-14 и glc-1), кодирующими α-субъединицы GluCls [6, 7, 45]. Мишенями действия макроциклических лактонов в организмах паразитических нематод также являются GluCls. Гены, кодирующие GluCl-подобные каналы, были обнаружены у H. contortus, A. suum, Dirofilaria immits и Onchocerca volvulus [6, 7, 45].
Изучение кинома C. elegans позволило выявить в организме этой нематоды 17 киназ, которые могут быть потенциальными мишенями действия лекарственных препаратов. По мнению авторов исследования [46], 3 из этих киназ (EGFR/LET-23, MEK1/MEK-2 и PLK1/PLK-1) можно рассматривать как потенциальные мишени при разработке новых антигельминтиков. Ранее [47–49] было показано, что EGFR/ERK- и MEK/ERK-киназы являются терапевтическими мишенями в организме Echinococcus multilocularis. Мишенями действия нематоцидов в организме Schistasoma mansoni являются EGFR/ERK- и PLK1-киназы [50–52].
В настоящее время C. elegans является одной из наиболее привлекательных моделей как для изучения механизмов и молекулярных мишеней токсического действия существующих нематоцидов, так и для поиска новых веществ с нематоцидной активностью. Первые результаты таких исследований были опубликованы в 1970-е годы, и с тех пор их количество ежегодно возрастает [1, 6–8, 12, 29–31, 34, 35, 42, 45, 53]. Регулярное применение лекарств для профилактики гельминтозов у сельскохозяйственных животных привело к появлению устойчивых к антигельминтикам форм паразитов и, как следствие, стимулировало поиск новых веществ с нематоцидной активностью и изучение механизмов и мишеней их действия на паразитических нематод [25, 53, 54]. При этом возможности проведения экспериментов с паразитическими нематодами in vitro ограничиваются их высокой стоимостью, сложностью жизненного цикла паразитов, невозможностью их культивирования вне организма хозяина, недостатком знаний о молекулярной генетике и ограниченным набором молекулярных методов исследования. Поэтому наиболее перспективными являются исследования, в которых оценивается нематоцидная активность одних и тех же препаратов одновременно в экспериментах с паразитическими нематодами и C. elegans.
В работе А. Burns и соавт. [13] описаны результаты скрининга 67 012 соединений на нематоцидную активность с использованием C. elegans в качестве тест-объекта. Среди всех исследованных веществ 275 вызывали гибель C. elegans в концентрации 60 мкМ и менее. Из этих 275 веществ 129 и 116 вызывали гибель не менее 90% Cooperia onchophora и H. contortus соответственно, а 103 обладали нематоцидной активностью в отношении всех трех видов нематод [13]. Скрининг более 26 000 химических соединений позволил выявить 14 веществ, оказывающих негативное влияние на развитие и плодовитость C. elegans. Эти вещества были токсичны для близкородственного C. elegans вида свободноживущих почвенных нематод Caenorhabditis briggsae и Meloidogyne hapla, паразитирующих на растениях [12]. В экспериментах с C. elegans показана нематоцидная активность толфенпирада, который используется в качестве контактного инсектицида [55]. Нематоцидная активность толфенпирада была выявлена и в отношении H. contortus [56]. Нематоцидная активность перексилина была подтверждена в экспериментах с C. elegans, H. contortus и Onchocerca lienalis (O. lienalis). Перексилин снижал двигательную активность C. elegans и H. contortus и вызывал паралич O. lienalis. Кроме этого, перексилин снижал уровень потребления кислорода C. elegans [14]. Содержащийся в корнях бархатцев Tagetes spp. α-тертиенил в концентрации 1, 2,5 и 5 мкМ вызывал гибель покоящихся личинок C. elegans и Meloidogyne incognita (M. incognita). Полулетальная концентрация (LC50) без фотоактивации составила 0,72±0,06 мкМ для C. elegans и 0,84±0,06 мкМ для M. incognita, а с фотоактивацией — соответственно 0,28±0,02 и 0,37±0,03 мкМ [57].
Одним из методов борьбы с фитопаразитическими нематодами является использование бактерий. В работе S. Montalvão и соавт. [58] показано, что штаммы Bacillus thuringiensis, токсичные для M. incognita в экспериментах in vivo и in vitro, вызывают гибель C. elegans in vitro. Таким образом, C. elegans можно использовать для предсказания токсичности бактериальных штаммов для M. incognita и других нематод, паразитирующих на растениях.
Выращивание C. elegans на среде, содержащей бактерии Xenorhabdus budapestensis, X. szentirmaii, X. doucetiae и X. nematophila в качестве источника питания, приводило к гибели нематод в течение 2–3 дней. Свободные от клеток супернатанты X. budapestensis, X. szentirmaii и X. doucetiae вызывали гибель соответственно 91,0; 90,3 и 77,0% C. elegans в течение 48 ч. Супернантанты X. szentirmaii и X. nematophila были токсичны для фитопаразитической нематоды Meloidogyne javanica, вызывая гибель соответственно 93,3% и 86,6% особей за 48 ч. Наиболее токсичными для нематод оказались выделенные из Xenohrabdus spp. фабклавины, рабдопептиды и ксенокумацины, которые вызывали за 48 ч гибель 95,3; 74,6 и 72,6% C. elegans и 82,0; 90,0 и 85,3% M. javanica соответственно [59].
Streptomyces spp. продуцируют большое количество биологически активных вторичных метаболитов. Многие из этих метаболитов обладают нематоцидной активностью. В качестве примера можно привести авермектин, продуцируемый S. avermitilis. Его полусинтетический аналог ивермектин вызывает паралич C. elegans и нарушает работу мышц глотки. Ивермектин подавляет пищевое поведение у паразитических нематод H. contortus, B. malayi, Trichostrongylus colubriformis и некоторых других [6, 7, 45]. Экстракт штамма Streptomyces sp. DT10 вызывал 100% летальность C. elegans. Выделенный из этого экстракта спектинабилин приводил к гибели личинок C. elegans первого возраста и нарушал двигательную активность личинок четвертого возраста. Нематоцидная активность спектинабилина была выявлена и в отношении личинок M. incognita [60].
Свободноживущая почвенная нематода C. elegans используется в качестве модельного организма в биологических исследованиях с середины 1960-х годов. Изучение C. elegans позволило разработать новые методы исследования различных биологических процессов. Кроме того, C. elegans оказалась привлекательной моделью для паразитологов. Эксперименты с C. elegans позволяют in vitro проводить поиск веществ с нематоцидной активностью, выявлять молекулярные мишени действия нематоцидов и изучать механизмы лекарственной устойчивости гельминтов. Справедливости ради следует отметить, что к настоящему времени на рынке антигельминтиков нет ни одного препарата, разработанного по результатам скрининга с использованием C. elegans. При этом надо иметь в виду, что поиск новых антигельминтных препаратов — это сфера деятельности, успех в которой достигается не часто. Это связано с особыми требованиями к таким лекарствам. Антигельминтные препараты должны обладать высокой эффективностью против паразитов, но быть нетоксичными для организма хозяина. Необходимо учитывать возможность накопления нематоцидов в тканях сельскохозяйственных животных и растений, используемых для питания человека. Нематоциды, используемые для обработки растений против фитопаразитических нематод, должны обладать высокой избирательностью, чтобы не причинять вред беспозвоночным, не являющимся мишенями их действия.
Дискуссия о возможности использования C. elegans как модели паразитических нематод ведется с первых упоминаний этой нематоды в научной литературе. Приведенные в настоящей статье данные показывают, что во многих случаях вещества, токсичные для C. elegans, токсичны для паразитических нематод, и наоборот. Вещества, вызывавшие гибель C. elegans, в 15 раз чаще приводили к гибели паразитических нематод, чем случайно выбранные. Кроме того, 40% веществ, летальных для C. elegans, были летальны для C. oncophora и H. contortus. Это и ряд других исследований позволяет сделать вывод о перспективности использования C. elegans в качестве альтернативной тест-системы в доклинических исследованиях для первичного скрининга антигельминтных препаратов с последующим их тестированием на паразитических нематодах. Такой подход позволит уменьшить количество позвоночных животных, требующихся для тестирования, снизить стоимость и сократить сроки исследования. Не вызывает сомнения и возможность использования C. elegans для понимания механизмов действия нематоцидов. В целом, можно сделать вывод, что C. elegans является полезной моделью как для поиска новых веществ с антигельминтной активностью, так и для решения проблемы преодоления лекарственной устойчивости гельминтов.
Автор заявляет об отсутствии конфликта интересов.